Donde guarda Ubuntu la configuraciónd e las unidades externas ???

Hola a todos:
Me encuentro con lo siguiente, tengo unos problemas que arrastro desde que tenía ubuntu 10.10, y que fui arrastrando hasta la versión 12.04 que tengo ahora, y todo por actualizar en vez de instalar desde un entorno limpio. La explicación es que , si lo hubiera hecho como se debe tendría el problema de que perdería la personalización en cuanto al aspecto de las carpetas que tengo en unos discos duros externos donde tengo mis colecciones de Musica, videos, fotos.....en vecon esto quiero decir que tengo la manía de darle a los directorios y subdirectorios que hay en ellos una imagen de unas fotos que tengo dentro de cada una con el objeto de relacione rapidamente la imagen de la carpeta con lo que tiene dentro. He de decir que hay en los discos tropocientas carpetas con esta personalizaciónzación y el problema surge que si hago una instalación limpia, pierdo todo este trabajo, y lo se por que ya me ha ocurrido antes, osea que Ubuntu en vez de guardar estos ajustes en el disco duro externo en cuestión , lo debe de hacer en el directorio raiz, por que ya digo que cuando formateas esta unidad de disco desaparece todo lo dicho annterior.Prueba de ello que cuando conectas ese disco duro a otro ordenador mediante el usb , este , no reconoce nada de dicha configuración y aparecen las carpetas amarillas sin fotos.

Ahora viene la pregunta del millón: Alguien puede decirme donde guarda Ubuntu dicha configuracion de las unidades extraibles para poder hacer un respaldo y cuando formatee volver a incluiir ese archivo o lo que sea y volver a tener todo el mismo aspecto de antes.......